Han var det äldsta överlevande barnet i en stor familj med arton barn som föddes av Jean-Baptiste Grignion och Jeanne Robert. Hans tidiga år tillbringades främst i Iffendic, där hans far hade förvärvat en gård med namnet "Le Bois Marquer".

Denna lantliga uppväxt spelade en viktig roll för att forma hans karaktär och andliga synsätt.

Redan i unga år visade Louis tecken på en exceptionell andlig mognad. Vid 12 års ålder började han på jesuitkollegiet St Thomas Becket i Rennes. Här utmärkte han sig akademiskt och utvecklade en djup entusiasm för andlighet och missionärsarbete. Under inflytande av berättelser från den lokale prästen Abbé Julien Bellier om livet som kringresande missionär kände han sig inspirerad att predika mission bland de fattiga.

Under sin tid på college började Louis känna en kallelse till prästämbetet. Efter att ha avslutat sin vanliga skolgång fortsatte han sina studier i filosofi och teologi vid S:t Thomas i Rennes.

Louis hälsa försämrades på grund av de hårda levnadsförhållandena i kombination med självpåtagna böter; efter mindre än två år blev han allvarligt sjuk och behövde läggas in på Hôtel-Dieu. Anmärkningsvärt nog överlevde han denna sjukdom trots rigorösa behandlingar som var vanliga vid den tiden. Efter att ha tillfrisknat fick han möjlighet att börja på Lilla Saint-Sulpice i juli 1695, där han tjänstgjorde som bibliotekarie och fördjupade sig i andlighet - särskilt med fokus på Marias roll i den.