Fenomenet kan fortsätta den 31 maj (lördag) och de följande dagarna, sade hälsomyndigheten i en not.
"En situation med dålig luftkvalitet förväntas på fastlandet, med en ökning av koncentrationerna av inandningsbara partiklar av naturligt ursprung i luften".
Denna förorening (inhalerbara partiklar) har effekter på människors hälsa, särskilt på den mest känsliga befolkningen, såsom barn och äldre.
Så länge detta fenomen pågår rekommenderar DGS att befolkningen undviker långvarig ansträngning, begränsar fysisk aktivitet utomhus och undviker exponering för riskfaktorer som tobaksrök och kontakt med irriterande ämnen.
På grund av sin större sårbarhet bör barn och äldre, liksom personer med kroniska andningsproblem och hjärt-kärlpatienter, förutom att följa de allmänna rekommendationerna, när så är möjligt stanna inomhus, helst med stängda fönster.
Vid förvärrade symtom rekommenderar DGS att man kontaktar Health 24 Line (808 24 24 24) eller vid behov söker vård.
Hälsomyndigheten säger också att APA:s(Portugals miljöbyrå) webbplats eller QualAr-appen kan konsulteras för "ytterligare information om luftkvalitet och värden som uppmätts vid övervakningsstationer".
DGS rekommenderade också förebyggande åtgärder denna vecka, till exempel dricksvatten, med tanke på prognoserna om stigande temperaturer under de kommande dagarna, som bör nå värden över 30°C i större delen av landet.
Enligt IPMA är Bragança, Évora, Guarda, Faro, Vila Real, Setúbal, Santarém, Lissabon, Beja, Castelo Branco och Portalegre under gul beredskap fram till kl. 18.00 på lördag på grund av prognosen om varmt väder.