La zone abrite des espèces endémiques, notamment l'otarie à fourrure Juan Fernández. L'initiative vise à protéger plus de 50 % des eaux chiliennes. La population de phoques chiliens s'est reconstituée et compte aujourd'hui environ 200 000 individus, alors qu'elle était autrefois en voie d'extinction.

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La réserve couvre environ 337 000 km² et il est prévu de l'étendre à près d'un million de kilomètres carrés. Le plan fait suite à des efforts de longue haleine des communautés locales et des groupes de protection de la nature, et la zone protégée deviendrait l'une des plus grandes réserves marines interdites au monde.