L'Autorité maritime nationale(AMN) a déclaré dans un communiqué que l'incident s'était produit "au cours d'une opération de recherche et de sauvetage de migrants au large des côtes de Lesbos" et qu'il y avait six personnes à bord, qui ont été "sauvées saines et sauves et sont en bonne condition physique".
La police portugaise a également souligné qu'"une enquête a déjà été ouverte pour déterminer les causes de l'incident".
La chaîne de télévision grecque ERT, citée par Europa Press, a indiqué que le navire portugais avait coulé vers 18 heures (16 heures à Lisbonne) lors d'une opération de recherche de quatre migrants à bord d'une pirogue (embarcation faite d'un seul tronc d'arbre) traversant la côte turque.
Une source des garde-côtes grecs a déclaré à l'Agence France-Presse(AFP) que le navire, qui fait partie de l'Agence européenne de garde-frontières et de garde-côtes(Frontex), a coulé après avoir heurté un récif près de l'île de Lesbos.
L'équipage du bateau était composé de cinq Portugais et d'un Grec, a-t-il ajouté.
"Il participait au sauvetage des migrants dans la zone, dans des conditions de vent presque soufflant en rafales", a-t-il expliqué.
L'opération a été lancée après que 36 migrants, repérés par la police sur une plage de Lesbos, ont signalé aux autorités que d'autres membres du groupe étaient portés disparus en mer.
Les garde-côtes grecs ont également indiqué que les recherches pour retrouver les migrants se poursuivaient.
Le rôle de Frontex est d'aider les pays de l'Union européenne (UE) et de l'espace Schengen à gérer leurs frontières extérieures.