Guerra Junqueiro przeżył wyjątkowe życie, będąc głosem ruchu antyestablishmentowego przeciwko monarchii i kościołowi. Później pogodził się z Kościołem i pisał o prostym życiu.

Niemniej jednak jego wpływ jest dobrze odczuwalny w historii. Jego dzieła były paliwem do ognia, który zakończył monarchię w Portugalii w 1910 roku, a jego spuścizna jest pamiętana w panteonie narodowym.