São Francisco-klostret och kyrkan, som ligger söder om den kulle där det berömda Convento do Cristo är beläget, vittnar om klosterlivets uthållighet. Komplexets väg till förverkligande präglades av en långdragen rättslig tvist.

Även om franciskanermunkarna ursprungligen fick kungligt tillstånd att bygga här redan 1562, motsatte sig ledaren för den mäktiga lokala Kristusorden projektet med kraft och inledde en rättslig strid om fastigheten. Det dröjde därför ända till 1624 innan bygget kunde påbörjas. De höll fast vid själva idén om detta kloster i mer än 42 år!

Kyrkans arkitektur, som är ett skolexempel på den så kallade ”Plain Style”. En unikt portugisisk arkitektonisk stil med geometriska linjer och en tydlig avsaknad av tunga yttre ornament. Inuti väcker altartavlan särskild uppmärksamhet.

Den föreställer inte bara Jesus, utan även Dismas och Gestas, de två tjuvarna vid hans sida, och till och med den romerska armén som spikade fast honom på korset.

Efter upplösningen av de religiösa ordnarna 1834 genomgick klostret en radikal sekularisering och fungerade i generationer som militärkasern. Den historiska kyrkan klarade dock dessa turbulenta politiska omvälvningar med bravur och är fortfarande fullt aktiv den dag i dag.