När han var en ung pojke försvann han från sitt hem. Ingenting är känt om hur detta gick till. Hans mor dog strax efter försvinnandet och hans far anslöt sig till franciskanerna. Han hamnade i Toledo i Spanien och togs om hand av Francisco Mayoral, som lät honom arbeta som herde. När han nådde 20-årsåldern upptäckte han att Mayoral ville att han skulle gifta sig med sin dotter så han gick med i den spanska armén.

I något skede befann han sig nära Portugal, där han spårade upp en farbror som berättade om sina föräldrar. Han insåg att han inte hade några band till Portugal och åkte tillbaka till Spanien.

Han vandrade runt i olika länder och sägs ha haft en vision av Jesusbarnet som ledde honom till Granada. Där fick han arbete på en ny tryckpress.

Han upplevde en religiös omvändelse på Sankt Sebastians högtid. Han började offentligt förnedra sig själv genom att slå och be om nåd för sitt tidigare liv. Han skickades till ett mentalsjukhus och fick där besök av Johannes av Avila som sa till honom att han borde ta hand om andra.

Han samlade en skara anhängare som tog hand om fattiga och sjuka, och som idag är kända som The Brothers Hospitallers of St John of God.

Han dog av lunginflammation på sin födelsedag efter att ha hoppat i en flod för att rädda en ung man. Hans högtidsdag firas den 8 mars och han är känd som en av de ledande religiösa gestalterna på Iberiska halvön. Han är skyddshelgon för bokhandlare, sjukhus, sjuksköterskor, psykiskt sjuka och döende.