Het betrokken vliegtuig, een Airbus A319 die al 20 jaar in dienst was en plaats bood aan ongeveer 150 passagiers, steeg omstreeks 20.27 uur op vanuit Lissabon.

Ongeveer een half uur na het opstijgen, terwijl het vliegtuig het Spaanse luchtruim boven de regio Ávila doorkruiste op een hoogte van 38.000 voet (ongeveer 11,5 kilometer), gaf de gezagvoerder een melding door aan de luchtverkeersleiding.

Volgens CNN Portugal bevestigde de luchtvaartmaatschappij dat vlucht EJU712466 was omgeleid vanwege een „technisch probleem”, waarbij werd vermeld dat er een vervangend vliegtuig en bemanning waren ingezet om de passagiers naar hun eindbestemming te vervoeren.

Hoewel de budgetluchtvaartmaatschappij de aard van de storing niet publiekelijk heeft gespecificeerd, blijkt uit gegevens van de vluchtvolgwebsite FlightRadar24 dat het vliegtuig onmiddellijk na de noodmelding een snelle daling uitvoerde tot onder de 10.000 voet.

Deze standaardveiligheidsprocedure wordt doorgaans toegepast in situaties waarbij sprake is van drukverlies in de cabine. In een verklaring aan de televisiezender herhaalde easyJet dat de veiligheid van passagiers en bemanning de hoogste prioriteit heeft, en benadrukte de maatschappij dat zij haar gehele vloot exploiteert in strikte overeenstemming met de richtlijnen van de fabrikant.